Gardos el terrorista ha despertado el arma antigua, Nalakuvera. Kojou y Sayaka apenas escapan con sus vidas, pero caen en las profundidades de la isla artificial. Asagi se apresura a analizar y controlar a Nalakuvera mientras Yukina libra una feroz batalla para detener a Gardos.

En una isla al sur de Japón se encuentra el Santuario Demoníaco, conocido como la Isla Itogami. En dicho lugar se cuentan rumores de la existencia del vampiro más fuerte del mundo, el Cuarto Progenitor, quien controla a los doce kenjuu de la calamidad. Al ser considerado una amenaza para el mundo la Organización Rey León envía a Yukina Himeragi, una maga de ataque y aprendiz de “Sword Shaman” para cumplir con la tarea de observar y eliminar a Kojou Akatsuki, un joven estudiante de preparatoria quien es sindicado como el Cuarto Progenitor.