Asagi ha quedado atrapado en el ataque de Kou. Kojou y Yukina se apresuran a salvarla, decidiendo llevarla al laboratorio de Mimori para recibir tratamiento ... pero cuando se detienen en el lugar de Kojou en el camino, otra personalidad se apodera del cuerpo de Asagi.

En una isla al sur de Japón se encuentra el Santuario Demoníaco, conocido como la Isla Itogami. En dicho lugar se cuentan rumores de la existencia del vampiro más fuerte del mundo, el Cuarto Progenitor, quien controla a los doce kenjuu de la calamidad. Al ser considerado una amenaza para el mundo la Organización Rey León envía a Yukina Himeragi, una maga de ataque y aprendiz de “Sword Shaman” para cumplir con la tarea de observar y eliminar a Kojou Akatsuki, un joven estudiante de preparatoria quien es sindicado como el Cuarto Progenitor.